On Friday, 7 June 2024 at 11:00 a.m., the defense of the dissertation thesis of Mgr. Jitka Janová will take place in the boardroom of the Institute of Molecular Biology of Plants.
Announcement of the dissertation defense here.
Refaunace a hmyz. Jak reagují hmyzí populace na návrat velkých býložravců (koně, tuři)?
Bc., Mgr., Ph.D. práce (Martin Konvička)
Volná pastva velkých býložravců je „optimistickou agendou“ ochrany přírody. Náš tým vede dlouhodobé studium dopadů refaunačních projektů na hmyz a další bezobratlé.
Hledá se: Kolega mobilní, schopný přežít mezi stády koní a turů a ochotný se učit.
Noční motýli malých izolovaných rašelinišť.
Bc. práce. (Pavel Vrba, Martin Konvička)
Výzkum fauny rašelinišť měl na Entomologickém ústavu dávnou, na nějaký čas přerušenou, tradici, na kterou navazujeme za mnohem vyspělejších technických podmínek.
Hledá se: Kolega připravený pozdě usínat a brzy vstávat, trpělivý u atlasů a určovacích klíčů.
Kolaps smrkových plantáží a zájmové druhy ochrany přírody.
Bc., Mgr. práce. (Pavel Vrba, Martin Konvička)
Co se stalo s tuzemskými hospodářskými smrčinami všichni víte. Možná ale nevíte, že dosud nikdo nesledoval vliv na jiné tvory, než lesní škůdce.
Hledá se: Student samostatný, pokud možno mobilní, schopný nasazení v terénu i u počítače.
Distribuční atlasy, geografie a ochrana přírody.
Bc., Mgr., Ph.D. práce (Zdeněk Fric, Martin Konvička)
Tzv. atlasy rozšíření obsahují víc fascinujících dat, než je běžný akademik schopen zpracovat do konce života. Lze z nich čerpat informace prakticky ochranářské, biogeografické i obecně ekologické.
Hledá se: Kolega zapálený pro přírodu v podobě jedniček a nul. Zběhlost ve statistice a GIS metodách vhodná, ale ne nezbytná. Vhodné i pro informatiky a příbuzné obory.
Housenky okáčů v zimě.
Bc., Mgr. práce (Pavel Vrba, Martin Konvička)
Možnost naskočit do rozjetého vlaku studia chladové odolnosti housenek, nyní již na populační úrovni.
Hledá se: kolega pečlivý a zručný v laboratoři.
Patrnosti ve fylogeografii a evoluci motýlů.
Mgr., PhD práce (Alena Sucháčková, Zdeněk Fric)
Nedávná i starší evoluce motýlů je solidně zmapována, což otevírá prostor pro zobecnění. Je například speciace rychlejší v tropech (jak se říká v učebnicích), nebo úplně jinde?
Hledá se: kolega odhodlaný pracovat s evolučními a geografickými programy, i když DNA by se též neměl bát.
Evoluce a biogeografie vybraných skupin (stále motýlů).
Bc., Mgr., PhD práce (Alena Sucháčková, Zdeněk Fric)
I když o evoluci motýlů mnoho víme, nezodpovězené otázky zůstávají. A to v blízkém západním palearktu, i v Africe, Asii a Tichomoří.
Hledá se: kdokoli se smyslem pro laboratorní dobrodružství.
Kontakty:
doc. Mgr. Martin Konvička, Ph.D., This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it., BC AV ČR, ENTÚ (ekologie, rewilding)
Zdeněk Fric, Ph.D., This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. BC AV ČR, ENTÚ, místnost 303 (biogeografie, fylogeneze)
Mgr. Alena Sucháčková, This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. BC AV ČR, ENTÚ, místnost 304 (bakaláři, biogeografie)
Dear students,
My name is Barbora Okosy. I am an Erasmus coordinator for the Faculty of Science.
Now the 2nd round of selection procedure is announced for the summer period of the academic year 2023/2024 and the academic year 2024/2025.
For more information please see the webpage in English with all the information for you: https://www.prf.jcu.cz/en/international-relations/international-mobilities/outgoing-erasmus-students-traineeship
It is important to fill in the application form until15.5.2024 by 12,00 am. You can send it by email or personally deliver to me (The Faculty of Science, building C, door number 14), and attach the motivation letter and the confirmation about your English skill (certification, TEOFL and so on). The traineeship must be at least for 2 months around the EU or for short time traineeship 5-30 days.
If you are interested, please do not hesitate to contact me. Your traineeship could be possible from June 2024.
Next term for the applications will be at the end of September and November.
Have a great day.
Best regards,
Mgr. Barbora Okosy
Faculty coordinator for foreign affairs
Faculty of Science
University of South Bohemia in České Budějovice
Branišovská 1760, building C, door number 14
370 05 České Budějovice
Czech Republic
e-mail: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.
tel.: +420 387 776 212
Letošní konference doktorandů naší katedry proběhla hybridně ve dnech 9. a 10. února 2022. V odkazech jsou uvedeny program konference a výsledky hodnoceni prezentací.
Oceněným studentům blahopřejeme a všem děkujeme za hojnou účast.
Ph.D. STUDENT – MARINE PARASITOLOGY
Applications are invited from suitably qualified students for one Ph.D. student position to work under the supervision of Dr Haseeb Randhawa and Dr Björn Schäffner at the Faculty of Life and Environmental Sciences, University of Iceland (HI). The position is funded by the IRF project grant (“Conservation of ancient relationships: Assessment of skates (Rajiformes: Rajidae) and their parasite fauna in Iceland”, IRF project no. 2410498-051).
The project aims to survey the status of parasitic organisms infecting skate hosts in marine ecoregions off Iceland to aid in the future implementation of conservation efforts of threatened host-parasite systems. Research goals will assess the entire diversity of parasites infecting this host group, assess the genetic diversity of skate species and parasite lineages, and evaluate the status of host-parasite systems based on IUCN Red List criteria to support their conservation through updated conservation agendas. This large-scale project benefits from the international cooperation between the Icelandic academic institution and the Natural History Museum, London, U.K. (NHM). It offers the research basis for one PhD project.
The PhD project contributes to the unknown faunal component of marine parasites infecting skate hosts with an active engagement in the Icelandic marine biodiversity assessment. Main tasks of the Ph.D. student will include (i) the assessment of parasite diversity using a combination of organismal-based and molecular-based studies; (ii) the evaluation of factors influencing the biogeographic distribution and dispersal of marine parasites in Icelandic ecoregions; (iii) the assessment of molecular data of both parasites and skate hosts via targeted sequencing (Sanger sequencing) and genome skimming via next generation sequencing (NGS); (iv) the application of 3D imaging of the neuromuscular system of exemplar parasite species using fluorescent in situ hybridisation (FISH) in combination with confocal microscopy; and (v) the assessment of IUCN Red List criteria of threatened host-parasite systems. The Ph.D. student will further be responsible for producing high quality data in the field and laboratory and will lead or be involved in the preparation of international publications and presentations of research outcomes at domestic and international conferences. Molecular research components, including phylogenetic analysis and barcoding, and FISH technologies will be performed at the NHM, London for at least 12 months of the project duration under the supervision of Dr. Peter Olson (NHM).
The selected Ph.D. student will be enrolled at HI and will conduct research both at HI and the NHM benefiting from world-class scientific infrastructure in Iceland and the United Kingdom with opportunities to spotlight the research and gain valuable experience in science communication. By conducting independent investigations in multidisciplinary research areas utilising facilities both in Iceland and the UK, the student will build a research profile, become experienced in publishing and project management, and gain experience in public engagement and student supervision. The doctoral student will be responsible for leading the main investigations under supervision to enhance and expand the professional career perspectives, highlighting transferrable strengths with lasting implications on future career prospects.
Ph.D. applicants must have been awarded the degree of B.Sc. (Honours) or M.Sc. in Parasitology, Ecology, Marine Biology or a related field, prior to the commencement of the Ph.D. project. Applicants should send a cover letter stating their interest in this position, a recent curriculum vitae and contact information of 2 academic referees. Application materials should be sent electronically to Dr Haseeb Randhawa (email: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.or Dr Björn Schäffner (email: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.). After initial review, confidential letters of recommendation will be requested from referees. Only complete applications will be reviewed at this time. The deadline for applications is May 31, 2024. Applications will continue to be accepted until this date, but those received after the review date will only be considered if the position has not yet been filled.
Further details regarding the University and how to apply for admission in postgraduate programs can be found at the following homepages:
https://english.hi.is/school_of_engineering_and_natural_sciences/doctoral_studies
Dijoux S. & Boukal D. S. (2021) Community structure and collapses in multi-channel food webs: role of consumer body sizes and mesohabitat productivities. Ecology Letters 24, 1607-1618.
Oborová rada doktorského studijního programu Hydrobiologie oznamuje konání obhajoby disertační práce doktorandky jménem
Obhajoba se bude konat dne 27. října 2023 od 9.30 hodin v posluchárně C1, budova C,
Branišovská 1760, 370 05 České Budějovice.
školitel doktorandky: doc. Mgr. Michal Koblížek, Ph.D.
oponenti disertační práce: Dr. Younghui Zeng, Prof. Dr. Irene Wagner-Döbler
prof. RNDr. Jaroslav Vrba, CSc.
předseda OR
Oborová rada doktorského studijního programu Ecosystem biology oznamuje konání obhajoby disertační práce doktoranda jménem
Obhajoba se bude konat dne 16. června 2023 od 10.00 hodin v zasedací místnosti děkanátu, budova C,
Branišovská 1760, 370 05 České Budějovice.
školitel doktoranda: doc. Ing. MgA David Boukal, Ph.D.
oponenti disertační práce: Prof. Sebastian Diehl, Prof. Ursula Gaedke
doc. RNDr. Jana Jersáková, Ph.D.
předsedkyně OR
Obhajoba disertační práce se bude konat dne 16. ledna 2023 od 10:30 v místnosti B1 Blažkova pavilonu.
Oznámení o konání obhajoby disertační práce ZDE.
Zdroj ilutsračního obrázku: Wikimedia Commons
1. dubna 2022 od 13.00 hodin v posluchárně B1 proběhne obhajoba disertační práce Pavla Soukupa.
Letošní ročník doktorandské konference studentů studijních programů Biologie ekosystémů a Ekologie a Hydrobiologie/Limnologie se konal 1. - 2. února 2023, a to opět tradičně ve Vodňanech, v areálu MEVPISu, který poskytuje skvělé zázemí pro setkání doktorandů z naší katedry, jejich školitelů a dalších zainteresovaných odborníků a zájemců o obor. Konference je dobrou příležitostí vzájemně se informovat o tématech, která se řeší na katedře (program). Letošní konference měla velmi dobrou úroveň, všem doktorandům děkujeme za hezky připravené prezentace. Zvlášť pak blahopřejeme těm, jejichž prezentace se auditoriu líbily nejvíc: ze studentů prvního ročníku to byl Kiran Thomas, z vyšších ročníků to byli Sophie Mennicken (bronz), Roudaina Boukheloua a Paul Layoun (stříbro) a Izabela Mujakić a Cristian Villena Alemany (zlato).
Letošní ročník doktorandské konference studentů studijních programů Biologie ekosystémů a Ekologie a Hydrobiologie/Limnologie se konal 6. - 7. února 2024, na půdě Přírodovědecké fakulty JU. Konference je dobrou příležitostí vzájemně se informovat o tématech, která se řeší na katedře (viz program níže). Děkujeme všem doktorandům za připravené prezentace. Zvlášť pak blahopřejeme trojici prezentujících, jejichž prezentace se auditoriu líbily nejvíc: Thomas Kiran, Roudaina Boukheloua a Paul Layoun, kteří všichni za své vystoupení dostali pomyslnou zlatou medaili, protože rozdíly mezi jejich vynikajícím hodnocením byly minimální.
Jedenáctý ročník mezinárodní letní školy Soil and Water proběhl tento rok opět na česko-německém pomezí Šumavy a závěrečná část pak na Dačicku. Letní škola byla organizována naší katedrou (Tomáš Picek a Zuzana Urbanová) ve spolupráci s Univerzitou v Ulmu. Letní školy se kromě pořádajících univerzit účastnili studenti z partnerských univerzit Estonian Univerzity of Life Sciences, Aix-Marseille Univerzité ale i studenti z Rakouska, Itálie či Brazílie.
Letní škola proběhla formou exkurzí vedených místními odborníky, pracovníky správy NP či výzkumnými pracovníky. Letní škola byla zahájena na bavorské straně Šumavy, výstupem na Grosser Arber, dále jsme navštívili oblast Svarohu a Černého jezera a smíšené „pralesovité“ porosty poblíž Bayerisch Eisenstein. Studenti navštívili i infocentrum NP Bayerischer Wald, kde byli v rámci odborné přednášky seznámeni s historií vzniku národního parku na obou stranách Šumavy a vývojem managementu v tomto území. V okolí Železné Rudy byl pro studenty připraven dvoudenní program ve spolupráci s NP Šumava v rámci projektu LIFE for MIRES (https://life.npsumava.cz). První den se studenti aktivně zapojili do revitalizace lokality Kameničná. Druhý den následovala exkurze v oblasti Skelné, kde byly v minulých letech revitalizovány prameniště a drobné potůčky.
Další dny se kurz přesunul na třeboňsko a dačicko. Navštívili jsme „eddy covariance“ věž pro měření bilance uhlíku na mokrých loukách u Třeboně a vegetační čistírnu odpadních vod ve Slavošovicích, dále pak rybniční a lesní ekosystémy v okolí Dačic, které v současnosti procházejí obrovskou disturbancí a změnou po odumření většiny smrkových monokultur.
Ph.D. STUDENT – MARINE PARASITOLOGY
Applications are invited from suitably qualified students for one Ph.D. student position to work under the supervision of Dr Haseeb Randhawa and Dr Björn Schäffner at the Faculty of Life and Environmental Sciences, University of Iceland (HI). The position is funded by the IRF project grant (“Conservation of ancient relationships: Assessment of skates (Rajiformes: Rajidae) and their parasite fauna in Iceland”, IRF project no. 2410498-051).
The project aims to survey the status of parasitic organisms infecting skate hosts in marine ecoregions off Iceland to aid in the future implementation of conservation efforts of threatened host-parasite systems. Research goals will assess the entire diversity of parasites infecting this host group, assess the genetic diversity of skate species and parasite lineages, and evaluate the status of host-parasite systems based on IUCN Red List criteria to support their conservation through updated conservation agendas. This large-scale project benefits from the international cooperation between the Icelandic academic institution and the Natural History Museum, London, U.K. (NHM). It offers the research basis for one PhD project.
The PhD project contributes to the unknown faunal component of marine parasites infecting skate hosts with an active engagement in the Icelandic marine biodiversity assessment. Main tasks of the Ph.D. student will include (i) the assessment of parasite diversity using a combination of organismal-based and molecular-based studies; (ii) the evaluation of factors influencing the biogeographic distribution and dispersal of marine parasites in Icelandic ecoregions; (iii) the assessment of molecular data of both parasites and skate hosts via targeted sequencing (Sanger sequencing) and genome skimming via next generation sequencing (NGS); (iv) the application of 3D imaging of the neuromuscular system of exemplar parasite species using fluorescent in situ hybridisation (FISH) in combination with confocal microscopy; and (v) the assessment of IUCN Red List criteria of threatened host-parasite systems. The Ph.D. student will further be responsible for producing high quality data in the field and laboratory and will lead or be involved in the preparation of international publications and presentations of research outcomes at domestic and international conferences. Molecular research components, including phylogenetic analysis and barcoding, and FISH technologies will be performed at the NHM, London for at least 12 months of the project duration under the supervision of Dr. Peter Olson (NHM).
The selected Ph.D. student will be enrolled at HI and will conduct research both at HI and the NHM benefiting from world-class scientific infrastructure in Iceland and the United Kingdom with opportunities to spotlight the research and gain valuable experience in science communication. By conducting independent investigations in multidisciplinary research areas utilising facilities both in Iceland and the UK, the student will build a research profile, become experienced in publishing and project management, and gain experience in public engagement and student supervision. The doctoral student will be responsible for leading the main investigations under supervision to enhance and expand the professional career perspectives, highlighting transferrable strengths with lasting implications on future career prospects.
Ph.D. applicants must have been awarded the degree of B.Sc. (Honours) or M.Sc. in Parasitology, Ecology, Marine Biology or a related field, prior to the commencement of the Ph.D. project. Applicants should send a cover letter stating their interest in this position, a recent curriculum vitae and contact information of 2 academic referees. Application materials should be sent electronically to Dr Haseeb Randhawa (email: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.or Dr Björn Schäffner (email: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.). After initial review, confidential letters of recommendation will be requested from referees. Only complete applications will be reviewed at this time. The deadline for applications is May 31, 2024. Applications will continue to be accepted until this date, but those received after the review date will only be considered if the position has not yet been filled.
Further details regarding the University and how to apply for admission in postgraduate programs can be found at the following homepages:
https://english.hi.is/school_of_engineering_and_natural_sciences/doctoral_studies
